通常、精製水調製システムのプロセス配置方式は地域と水源によって異なり、精製水調製システムは異なる原水水質の状況に基づいて分析と計算を行い、それから相応のコンポーネントを配置して各指標を順次許容範囲内に処理しなければならない。現在、国内で精製水製造システムの主なプロセス方式は以下の通りである：

1、前処理システムのプロセスフロー：水道水進水→原水槽→原ポンプ→多媒体フィルター→活性炭フィルター→軟化フィルター→保安フィルター。水道水は前処理処理された後、RO逆浸透システムの入水要求に達する。

2、逆浸透システムのプロセス：①プロセス：前処理システム→一級高圧ポンプ→一級RO逆浸透→段間純水タンク→二級高圧ポンプ→二級RO逆浸透→無菌純水タンク。

②プロセス：前処理システム→一級高圧ポンプ→一級RO逆浸透→段間純水タンク→二級高圧ポンプ→二級RO逆浸透→二級純水タンク→エディ輸送ポンプ→エディ電気除塩システム→無菌純水タンク。

③プロセス：前処理システム→一級高圧ポンプ→一級RO逆浸透膜→純水タンク→エディ輸送ポンプ→エディ電気除塩システム→無菌純水タンク。以上のプロセスにより水中の各種イオン、微生物を除去し、水を生産する水質は薬局方の要求に合致する。

3、滅菌及び輸送分配システム

滅菌プロセス：無菌純水タンク→UV紫外滅菌器→0.22μm終端フィルター→出水口、

滅菌プロセス：無菌純水タンク→オゾン滅菌装置→UV紫外滅菌器→0.22μm終端フィルター→出水口→輸送管を接続する、

消毒方式を選択することができる：活性炭低温消毒、CIP洗浄システム、分配システムオゾン殺菌、分配システム低温消毒、分配システム純蒸気殺菌。